Homologeneの相同遺伝子(HomoloGene:4597)
H.sapiens   SMC1A
structural maintenance of chromosomes 1A.
NP_006297.2   1233 aa
(NM_006306.2)
Conserved Domains
C.familiaris   SMC1A
structural maintenance of chromosomes 1A.
XP_538049.2   1295 aa
(XM_538049.2)
Conserved Domains
B.taurus   SMC1A
structural maintenance of chromosomes 1A.
NP_777039.1   1233 aa
(NM_174614.1)
Conserved Domains
M.musculus   Smc1a
structural maintenance of chromosomes 1A.
NP_062684.1   1233 aa
(NM_019710.1)
Conserved Domains
R.norvegicus   Smc1a
structural maintenance of chromosomes 1A.
NP_113871.1   1233 aa
(NM_031683.1)
Conserved Domains
D.rerio   smc1a
structural maintenance of chromosomes 1A.
XP_688120.2   1232 aa
(XM_683028.3)
Conserved Domains
D.melanogaster   SMC1
SMC1.
NP_651211.2   1238 aa
(NM_142954.3)
Conserved Domains
A.gambiae   AgaP_AGAP002947
AGAP002947-PA.
XP_311953.3   1244 aa
(XM_311953.3)
Conserved Domains
C.elegans   him-1
High Incidence of Males (increased X chromosome loss).
NP_001040658.2   1262 aa
(NM_001047193.3)
Conserved Domains
S.pombe   psm1
mitotic cohesin complex subunit Psm1 (PMID 11069892).
NP_596049.1   1233 aa
(NM_001021960.1)
Conserved Domains
S.cerevisiae   SMC1
Smc1p.
NP_116647.1   1225 aa
(SMC1_14318514)
Conserved Domains
K.lactis   KLLA0D07502g
hypothetical protein.
XP_453397.1   1243 aa
(XM_453397.1)
Conserved Domains
E.gossypii   AGOS_AGL023W
AGL023Wp.
NP_986643.1   1222 aa
(NM_211705.1)
Conserved Domains
M.grisea   MGG_06894
hypothetical protein.
XP_370397.2   1220 aa
(XM_370397.2)
Conserved Domains
N.crassa   NCU01323.1
hypothetical protein ( (AL451017) related to SMC1 protein [Neurospora crassa OR74A] ).
XP_326816.1   1241 aa
(XM_326815.1)
Conserved Domains
A.thaliana   TTN8
TTN8 (TITAN8); ATP binding / transporter.
NP_191027.3   1238 aa
(NM_115324.3)
Conserved Domains
O.sativa   Os12g0641500
hypothetical protein.
NP_001067404.1   632 aa
(NM_001073936.1)
Conserved Domains
P.falciparum   PF11_0317
structural maintenance of chromosome protein.
XP_001347988.1   1818 aa
(XM_001347952.1)
Conserved Domains

配列類似性に基づく相同遺伝子
—脊椎動物・ハエのオーソログ遺伝子と脊椎動物で生じたパラログ遺伝子—
系統樹:

=種分岐、 赤=遺伝子重複、 ピンク文字=当該ヒト遺伝子のオーソログ
HUMAN=ヒト、MOUSE=マウス、CHICK=ニワトリ、 ORYLA=メダカ、DROME=ショウジョウバエ
アライメント情報:
系統樹作成に使用された配列データ:
symbol gene ACC peptide ACC
FBpp0083926 FBgn0040283 SMC1_DROME
ENSP00000323421 ENSG00000072501 SMC1A_HUMAN
ENSMUSP00000044645 ENSMUSG00000041133 Smc1a_MOUSE
ENSORLP00000009230 ENSORLG00000007360 Q7SZI8_ORYLA
ENSGALP00000022963 ENSGALG00000014228 IPI00572844.3_CHICK
ENSP00000350036 ENSG00000077935 SMC1B_HUMAN
ENSMUSP00000023068 ENSMUSG00000022432 Smc1b_MOUSE
関連する遺伝子へのリンク: none
遺伝子シンボル:SMC1A(CDLS2, DKFZp686L19178, DXS423E, KIAA0178, MGC138332, SB1.8, SMC1, SMC1L1, SMC1alpha, SMCB)
遺伝子名:structural maintenance of chromosomes 1A

要約
《1》姉妹染色分体》の適切な結合は、《細胞分裂》の間の《染色体》の正確な分離のために必要である。姉妹染色分体の結合には《コヒーシン》多タンパク質複合体が必要である。この《複合体》の一部は、2つの染色体構造維持(SMC)タンパク質(SMC3とSMC1L2あるいはこの遺伝子が指令するタンパク質)で構成される。コヒーシン複合体の大部分は《有糸分裂》の前に染色体から解離するが、《動原体》部分の複合体は残る。したがって、指令されるタンパク質は動原体の機能に重要な部分であると考えられる。さらにこのタンパク質はBRCA1と相互作用し、ATMによりリン酸化され、DNA修復において働く可能性が示唆される。この遺伝子はSMC《遺伝子族》に属し、X不活性化を免れた《1》X染色体》の領域に位置する。

オリジナルDBにおけるID・ACC(クリックするとオリジナルDBへジャンプします)

Alignened RefSeq
8243
no.transcript ACCpeptide ACC
1NM_006306.2 NP_006297.2

ゲノム配列上位置
chromosomeX
basefrom 53401070 to 53449618
strand-

エクソン・イントロン構造(クリックするとゲノムビューアへジャンプします)
NCBINM_006306.2   エクソン数:25   塩基数:9725
EnsemblENSP00000323421   エクソン数:25   塩基数:9725
EnsemblENSP00000364489   エクソン数:25   塩基数:5837
EnsemblENSP00000344906   エクソン数:6   塩基数:677
EnsemblENSP00000413509   エクソン数:5   塩基数:868
NcanchrX.384.a   エクソン数:22   塩基数:4119

文献での共起性を基にした関連付け(クリックすると該当遺伝子のページへジャンプします)
遺伝子シンボル
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SMC1ANIPBLSMC3
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配列類似性を基にした関連付け(クリックすると該当遺伝子のページへジャンプします)
この遺伝子に関連付けはありません