Homologeneの相同遺伝子(HomoloGene:
4597
)
H.sapiens
SMC1A
structural maintenance of chromosomes 1A.
NP_006297.2
1233 aa
(NM_006306.2)
C.familiaris
SMC1A
structural maintenance of chromosomes 1A.
XP_538049.2
1295 aa
(XM_538049.2)
B.taurus
SMC1A
structural maintenance of chromosomes 1A.
NP_777039.1
1233 aa
(NM_174614.1)
M.musculus
Smc1a
structural maintenance of chromosomes 1A.
NP_062684.1
1233 aa
(NM_019710.1)
R.norvegicus
Smc1a
structural maintenance of chromosomes 1A.
NP_113871.1
1233 aa
(NM_031683.1)
D.rerio
smc1a
structural maintenance of chromosomes 1A.
XP_688120.2
1232 aa
(XM_683028.3)
D.melanogaster
SMC1
SMC1.
NP_651211.2
1238 aa
(NM_142954.3)
A.gambiae
AgaP_AGAP002947
AGAP002947-PA.
XP_311953.3
1244 aa
(XM_311953.3)
C.elegans
him-1
High Incidence of Males (increased X chromosome loss).
NP_001040658.2
1262 aa
(NM_001047193.3)
S.pombe
psm1
mitotic cohesin complex subunit Psm1 (PMID 11069892).
NP_596049.1
1233 aa
(NM_001021960.1)
S.cerevisiae
SMC1
Smc1p.
NP_116647.1
1225 aa
(SMC1_14318514)
K.lactis
KLLA0D07502g
hypothetical protein.
XP_453397.1
1243 aa
(XM_453397.1)
E.gossypii
AGOS_AGL023W
AGL023Wp.
NP_986643.1
1222 aa
(NM_211705.1)
M.grisea
MGG_06894
hypothetical protein.
XP_370397.2
1220 aa
(XM_370397.2)
N.crassa
NCU01323.1
hypothetical protein ( (AL451017) related to SMC1 protein [Neurospora crassa OR74A] ).
XP_326816.1
1241 aa
(XM_326815.1)
A.thaliana
TTN8
TTN8 (TITAN8); ATP binding / transporter.
NP_191027.3
1238 aa
(NM_115324.3)
O.sativa
Os12g0641500
hypothetical protein.
NP_001067404.1
632 aa
(NM_001073936.1)
P.falciparum
PF11_0317
structural maintenance of chromosome protein.
XP_001347988.1
1818 aa
(XM_001347952.1)
配列類似性に基づく相同遺伝子
—脊椎動物・ハエのオーソログ遺伝子と脊椎動物で生じたパラログ遺伝子—
系統樹:
青
■
=種分岐、 赤
■
=遺伝子重複、 ピンク
文字
=当該ヒト遺伝子のオーソログ
HUMAN=ヒト、MOUSE=マウス、CHICK=ニワトリ、 ORYLA=メダカ、DROME=ショウジョウバエ
アライメント情報:
系統樹作成に使用された配列データ:
symbol
gene ACC
peptide ACC
FBpp0083926
FBgn0040283
SMC1_DROME
ENSP00000323421
ENSG00000072501
SMC1A_HUMAN
ENSMUSP00000044645
ENSMUSG00000041133
Smc1a_MOUSE
ENSORLP00000009230
ENSORLG00000007360
Q7SZI8_ORYLA
ENSGALP00000022963
ENSGALG00000014228
IPI00572844.3_CHICK
ENSP00000350036
ENSG00000077935
SMC1B_HUMAN
ENSMUSP00000023068
ENSMUSG00000022432
Smc1b_MOUSE
関連する遺伝子へのリンク: none
遺伝子シンボル:
SMC1A(CDLS2, DKFZp686L19178, DXS423E, KIAA0178, MGC138332, SB1.8, SMC1, SMC1L1, SMC1alpha, SMCB)
遺伝子名:
structural maintenance of chromosomes 1A
要約
《1》姉妹染色分体》の適切な結合は、《細胞分裂》の間の《染色体》の正確な分離のために必要である。姉妹染色分体の結合には《コヒーシン》多タンパク質複合体が必要である。この《複合体》の一部は、2つの染色体構造維持(SMC)タンパク質(SMC3とSMC1L2あるいはこの遺伝子が指令するタンパク質)で構成される。コヒーシン複合体の大部分は《有糸分裂》の前に染色体から解離するが、《動原体》部分の複合体は残る。したがって、指令されるタンパク質は動原体の機能に重要な部分であると考えられる。さらにこのタンパク質はBRCA1と相互作用し、ATMによりリン酸化され、DNA修復において働く可能性が示唆される。この遺伝子はSMC《遺伝子族》に属し、X不活性化を免れた《1》X染色体》の領域に位置する。
オリジナルDBにおけるID・ACC
(クリックするとオリジナルDBへジャンプします)
Alignened RefSeq
8243
no.
transcript ACC
peptide ACC
1
NM_006306.2
NP_006297.2
ENSG00000072501
no.
transcript ACC
peptide ACC
1
ENST00000322213
ENSP00000323421
2
ENST00000375340
ENSP00000364489
3
ENST00000340213
ENSP00000344906
4
ENST00000428014
ENSP00000413509
chrX.384.a
ゲノム配列上位置
chromosome
X
base
from 53401070 to 53449618
strand
-
extract sequence
エクソン・イントロン構造
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NCBI
NM_006306.2
エクソン数:
25
塩基数:
9725
Ensembl
ENSP00000323421
エクソン数:
25
塩基数:
9725
Ensembl
ENSP00000364489
エクソン数:
25
塩基数:
5837
Ensembl
ENSP00000344906
エクソン数:
6
塩基数:
677
Ensembl
ENSP00000413509
エクソン数:
5
塩基数:
868
Ncan
chrX.384.a
エクソン数:
22
塩基数:
4119
文献での共起性を基にした関連付け
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遺伝子シンボル
共起性に関する詳細情報のページはこちら
SMC1A
NIPBL
SMC3
このネットワーク中に表示されている
は遺伝子を表します。赤色背景は表示中ページで着目する遺伝子です。遺伝子間の線は、遺伝子シンボルが同じ文献に出現する傾向(共起性)があることを表しています。線の太さはその強さを表します。着目する遺伝子と共起性を持つ遺伝子と、更にそれら遺伝子と共起性を持つ遺伝子が表示されています。
配列類似性を基にした関連付け
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この遺伝子に関連付けはありません