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バイオポータルプロジェクトでは、誰もが簡単にゲノム情報やデータベース、解析プログラムを利用できる環境の提供を目指しています。現在、試作中のものも含まれますが、どうぞご利用下さい。




三菱総合研究所

ゲノムビューア

ヒト、チンパンジ、マウス、ラットゲノムのブラウザを開発しました。たいへん軽快に動きます。、遺伝子解説ページを日本語で用意したほか、文献共起や配列類似性をもとに、遺伝子間の関連性をグラフ化してあります。情報がページに集約されているのであちこちのウェブサイトを渡り歩く必要がありません。

リンク

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用語解説

Webサービス】近年、DDBJを始めとする国内外のサイトが、データや機能の提供手段として、Webブラウザーへのインターフェースやファイル転送プロトコール(FTP) に加えて、プログラムからの直接利用に対するインターフェースであるWebサービスを 公開してきています。また、複数のWebサービスを部品として一定の解析を実現する ワークフローの構築も進んでいます。

メタデータ】「データに関するデータ」、もしくは、「データに関する構造化されたデータ」。図書館の図書カードが例で、効率よく情報を整理、検索するために、データが持つ意味について、一定の形式や共通したカテゴリのもとに記述される。インターネット上の情報の増加とともに、必須なものとされている。



国立遺伝学研究所DDBJ

バイオWebサービスとワークフロー

このメニューでは、バイオインフォマティクスの解析に役立つ「Webサービス」や「ワークフロー」をキーワードで検索すること ができます。たとえば、「相同性」で検索すると相同性検索プログラムBlastおよび Fastaのさまざまな使い方をメソッドとして自作のプログラムから呼び出す方法へとたどることができます。また、メソッドを利用したワークフローの例も確かめることがで きます。



東京理科大学

バイオデータベースショウケース

東京理科大の開発するメタデータベース。主要なバイオ関連データベースを網羅し、データの種類、所在や検索パラメータ(GUI)をデータベース化しています。利用者は、世界中に散在するデータベースの中から、データの種類と目的に応じて最適なデータベースを見つけることができます。


国立遺伝学研究所DDBJ

ゲノムメニュー

ゲノムメニューは様々な生物種ごとにゲノム情報をまとめたものです。ヒトやマウスをはじめ植物や細菌などの主要ゲノムデータがリンクされています。生物種は、和名・学名の両方で検索できます。(現在和名での登録は限られた生物種のみになっています。)「キーワード」の入力欄に和名または学名を入力し、検索ボタンを押してください

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